Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL7

VPS13A, Vacuolar protein sorting-associated protein 13A, humanhuman

Predictions only

Length 3,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13AQ96RL7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS13AQ96RL7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS13AQ96RL7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS13AQ96RL7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms