Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX18Q96RF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX18Q96RF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX18Q96RF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms