Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNPC3Q96LT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNPC3Q96LT9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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