Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM47Q96LD4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM47Q96LD4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms