Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK3Q96L96 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALPK3Q96L96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms