Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARK4Q96L34 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARK4Q96L34 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARK4Q96L34 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARK4Q96L34 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARK4Q96L34 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARK4Q96L34 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARK4Q96L34 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms