Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA3Q96KX2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms