Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRIQ1Q96JM4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRIQ1Q96JM4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
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