Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM3Q96HU1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms