Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSANTD3Q96H12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSANTD3Q96H12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms