Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTV1Q96GA3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms