Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39LQ96EH5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL39LQ96EH5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms