Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MS4A6EQ96DS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A6EQ96DS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A6EQ96DS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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