Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA4Q96DD7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms