Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCN3Q96D15 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCN3Q96D15 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms