Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAF2Q96CS3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAF2Q96CS3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms