Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCC1Q96CN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GCC1Q96CN9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms