Protein–RNA interactions for Protein: Q96C01

FAM136A, Protein FAM136A, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM136AQ96C01 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM136AQ96C01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM136AQ96C01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms