Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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