Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP1MTQ969P6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1MTQ969P6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms