Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-CQ95604 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-CQ95604 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms