Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms