Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3BQ92485 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms