Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIRE2Q8WWL2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms