Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB4Q8WW32 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB4Q8WW32 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms