Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE1Q8WV22 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms