Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PJA1Q8NG27 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PJA1Q8NG27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PJA1Q8NG27 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms