Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPV1Q8NER1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPV1Q8NER1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPV1Q8NER1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms