Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBOF1Q8ND07 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms