Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PNLDC1Q8NA58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms