Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8N8P6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8N8P6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8N8P6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8N8P6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8N8P6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8N8P6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8N8P6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8N8P6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8N8P6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8N8P6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8N8P6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8N8P6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms