Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSGALNACT2Q8N6G5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSGALNACT2Q8N6G5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSGALNACT2Q8N6G5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.9 ms