Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL2Q8N4E4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL2Q8N4E4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms