Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1F7

NUP93, Nuclear pore complex protein Nup93, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP93Q8N1F7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP93Q8N1F7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP93Q8N1F7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms