Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNGA4Q8IV77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms