Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREML1Q86YW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms