Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALB2Q86YC2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms