Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DZIP3Q86Y13 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DZIP3Q86Y13 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms