Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI1

PKHD1L1, Fibrocystin-L, humanhuman

Predictions only

Length 4,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1Q86WI1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1L1Q86WI1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1L1Q86WI1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms