Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF3Q86WH2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms