Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALYREFQ86V81 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALYREFQ86V81 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms