Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00523Q86TU6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00523Q86TU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms