Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLASP1Q7Z460 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLASP1Q7Z460 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLASP1Q7Z460 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms