Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC6Q7Z403 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms