Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBE3BQ7Z3V4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms