Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF550Q7Z398 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF550Q7Z398 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms