Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PREX2Q70Z35 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PREX2Q70Z35 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PREX2Q70Z35 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PREX2Q70Z35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PREX2Q70Z35 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PREX2Q70Z35 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PREX2Q70Z35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PREX2Q70Z35 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms