Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC36A4Q6YBV0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms