Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HACD2Q6Y1H2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD2Q6Y1H2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms