Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD9BQ6WBX8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD9BQ6WBX8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms